Badanie przeprowadza się z zastosowaniem urządzenia Gastrolyzer Gastro+ i jest bardzo proste. Badanie polega na pobieraniu próbek powietrza wydychanego przez pacjenta w specjalny aparat, który następnie podaje zawartość wodoru w wydychanym powietrzu. Pierwszy pomiar wykonuje się na czczo, kolejne po wypiciu określonego substratu rozpuszczonego w wodzie (np. laktozy, laktulozy, fruktozy, sorbitolu, ksylitolu, glukozy)  zależnie od wskazań i zlecenia lekarskiego. Pomiary powtarza się kilkukrotnie w 20-minutowych odstępach czasu. Łącznie badanie trwa 3h.